Fundada en 1292 por orden del arzobispo de Nóvgorod Clemente. El templo contiene los elementos de la arquitectura occidental, que muestra la relación creativa de Nóvgorod y Europa Occidental. La sensación de solidez y la unidad de la apariencia del templo se puedenotar en las palabras de un estudioso ruso "como una piedra única." Según la leyenda la iglesia fue construida en el sitio del descubrimiento milagroso del icono de San Nicolás, en el siglo XII que hasanado a Mstislav, que ordenó a construir entonces la Catedral de San Nicolás, el templo del príncipe en la Corte de Yarosláv.
La imagen de San Nicolás de la iglesia del lago Lipno es el icono de San Nicolás de Myra, del año 1294, del maestro de Alexa Petrov. Este es uno de los primeros iconos firmadosexistentes en Rusia. El icono de "Nicolás de Lipno" se exhibe en las salas del museo de Nóvgorod.
El templo está situado en la isla Lipno, una de las islas en la delta del río Msta. Se puede llegar por el agua: un barco o una embarcación.
St. Nicholas church on the Island of Lipno from Hippo on Vimeo.